Свято-Духов монастырь впервые упоминается в летописях 1162 года. В 1386 году, при приближении войск Дмитрия Донского, монастырь, как и многие другие, был сожжен. Это делалось для того, чтобы противник не мог использовать его как место для отдыха и снабжения. К концу XVIII века мужской монастырь был упразднен, а его монахов перевели на Валаам. Впоследствии Свято-Духов монастырь был возрожден уже как женский.
В наши дни из всех построек сохранились лишь каменная церковь Сошествия Святого Духа и трапезная церкви Троицы. Эти сооружения заметно выделяются среди других новгородских церквей благодаря обилию декоративных элементов и изящным деревянным куполам, установленным на высоких и узких барабанах. Обе постройки оставлены без штукатурки, что дает возможность увидеть уникальные особенности кирпичной кладки в их оригинальном виде.