Троицкая церковь в Хохловском переулке была известна как Троицкая
церковь в Хоxлах, Троицкая церковь в Хохловке и даже Троицкая
церковь в Старом Саде. Район стал называться Хохловкой в середине
XVII века, когда здесь поселились днепропетровские казаки и
разместилась плантация гетмана Мазепы. По приказу Василия I рядом с
дворцом был разбит сад, поэтому его называют Старым садом.
Первое упоминание об этой церкви относится к 1610 году. В середине
того же века церковь упоминается в архитектурных книгах как
каменная, а среди ее прихожан были представители известных
московских фамилий - Хитрово, Гребовы, Измайловы. Позже к ним
добавились семьи Голицыных, Сытиных и Шереметевых.
Во второй
половине XVII в. церковь была частично отремонтирована, и известно,
что 10 рублей на ее ремонт пожертвовал и царь Алексей Михайлович. В
это время приделы храма были освящены в честь Пятидесятницы
преподобного Сергия Радонежского и апостолов. Территорию прихода
занимал род Лопухиных, попавший в опалу после брака Евдокии
Лопухиной с Петром I, после которого императрица была заключена в
монастырь, и после ее близости ко двору; в конце XVII века Евдокия
Чирикова, сестра тестя императора Федора Лопухина, пожертвовала
средства на обновление церкви. Новое кирпичное здание было богато
украшено в традициях московского барокко.
Однако комплекс
сильно пострадал от сильного пожара 1737 года, а в конце 40-х годов
крыша была уничтожена повторными пожарами; следующий капитальный
ремонт был проведен в конце XIX века, так как церковь мало
пострадала во время Отечественной войны 1812 года.
В 30-е
годы прошлого века церковь была закрыта, часовня исчезла, и в ней
разместился Музей антропологии Московского университета; в 70-80-е
годы здание было восстановлено, и в нем разместились научные
учреждения нефтегазовой отрасли; в 90-е годы здание было передано
прихожанам; в 90-е годы здание было продано прихожанам; в 90-е годы
церковь была восстановлена, часовня перенесена в новое здание, а
музей переведен на новое место.